Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf541Q0GGX2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms