Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms