Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc4Q08624 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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