Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms