Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms