Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MestQ07646 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MestQ07646 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MestQ07646 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MestQ07646 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MestQ07646 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MestQ07646 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MestQ07646 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MestQ07646 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MestQ07646 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms