Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nfe2Q07279 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nfe2Q07279 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms