Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms