Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox9Q04887 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox9Q04887 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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