Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd1Q04519 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms