Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff2Q03404 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms