Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms