Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ascl1Q02067 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms