Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VcpQ01853 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms