Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms