Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme2Q01768 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms