Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms