Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms