Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms