Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms