Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms