Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms