Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp9bP98195 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms