Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Npas2P97460 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms