Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smyd1P97443 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smyd1P97443 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smyd1P97443 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smyd1P97443 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms