Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1bP97358 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1bP97358 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms