Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx1P83917 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cbx1P83917 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cbx1P83917 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cbx1P83917 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms