Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NyxP83503 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NyxP83503 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NyxP83503 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
NyxP83503 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms