Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms