Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx3P81067 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms