Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms