Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad1P70340 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms