Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms