Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd13P70217 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd13P70217 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd13P70217 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd13P70217 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd13P70217 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxd13P70217 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hoxd13P70217 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hoxd13P70217 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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