Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkcbP68404 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms