Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms