Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rab3cP62823 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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