Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lsm5P62322 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms