Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snrpd3P62320 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms