Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms