Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

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Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Copz1P61924 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms