Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms