Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms