Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdhd1P59328 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdhd1P59328 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms