Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd4P58467 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms