Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms