Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp25P57080 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.6 ms