Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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