Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms