Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcanP55066 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcanP55066 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcanP55066 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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